在中国宗教学会举办的藏学研讨会上，有人问：“密乘的修持理论与实践和现代科学有什么关系？”
秋英多杰仁波切回答：“密宗基道果的理论与修证，不是唯心的，是一个实实在在的生理和心理的实践过程，就像开采金矿的过程一样，去除杂质，提炼纯金。一位瑜伽士，通过修行，可以清除身口意中不净的成份，清除的过程中，就能体验到道果的密意。
所以，密宗修持的理论与实践，为现代科学开发人体的潜能，探索生命的奥秘，提供了绝好的依据。
现代科学在努力探索宇宙人生的奥秘，密宗同样也是探索宇宙人生的奥秘。密宗是直接体认，直达本体，一样具有科学的实验性和应用性。
密宗修持的本身，就具备了科学的实验性和实用性。
密法可以重复在无数人身上进行实验，最终，早晚都可以达到同一个目标，即成就佛菩萨的果位，古今无数的大成就者就是最好的证明，这是其实验性。
密法可以解决我们的终极问题，解决人类生老病死的问题，解决众生离苦得乐的问题，解决脱离轮回的问题，这是其实用性。
从某个角度来看，密宗的理论和修持与现代科学有相通之处。”
仁波切认为：从萨迦派的特点来讲，有“四种真实”的教言。首先，通过修持，身心有了真实的体验；依真实的体验，而了知真实的上师；因真实的上师，而对上师的密续要义，生起真实的信解；因真实的要义教授，确认上师们持有的佛陀心印、表示与口耳三种殊胜的传承，为真实的传承。这“四种真实”的观点，与科学的求真的精神，有什么不同吗？
在《和平的呼唤》一文中，仁波切开示道：“在当今这个时代，纵观世界上科技文化的总体因缘发展趋势，有欧美为主的西方文化，他们着重于外界的物质，进行科技研究，进行文化创新，另有以亚洲藏汉区域为主的东方文化，侧重于内在的人体密义学等传统文化的开发和研究。”
仁波切又开示：
“如是前言与绪论，论述宇宙与星球，
百家争鸣花齐放，当今世上兴科学，
敞开研究之大门，科学对于物质界，
成住坏空有论述，实事求是作解说，
谓此地球为球形，依靠引力旋于空，
日月星辰遍宇宙，众所周知此观点。
古代宇宙星球论，即是无上《时轮续》，”
仁波切常引用《文殊大幻化网续》中的偈颂：
“吉祥游宿之坛城，遍满十方虚空界。”
以此来说明，十方宇宙（法界）的虚空中，所有的日月星辰，都是具有内外密三中含义的。
仁波切提倡佛法的实证者与当代的科学家对话，采取多种的沟通方式，为人类和众生未来的福祉，共同探讨宇宙人生的真理。
